Молекулярная морфология. Методы флуоресцентной и конфокальной лазерной микроскопии - Коллектив авторов
- Дата:05.06.2024
- Категория: Научные и научно-популярные книги / Медицина
- Название: Молекулярная морфология. Методы флуоресцентной и конфокальной лазерной микроскопии
- Автор: Коллектив авторов
- Просмотров:0
- Комментариев:0
Шрифт:
Интервал:
Закладка:
Молекулярная морфология. Методы флуоресцентной и конфокальной лазерной микроскопии
УСЛОВНЫЕ СОКРАЩЕНИЯ
АТ-пара – пара нуклеотидов аденин – тимин
АТФаза – аденозинтрифосфатаза
ГАМК – гамма-аминомасляная кислота
ГДК – глутаматдекарбоксилаза
ГЦ-пара – пара нуклеотидов гуанин – цитозин
дцДНК – двухцепочечная
ДНК ММ – молекулярная масса
НК – нуклеиновые кислоты
оцДНК – одноцепочечная
ДНК ПЦР – полимеразная цепная реакция
РНК – рибонуклеиновая кислота
СФ – синаптофизин
ФСБ – фосфатно-солевой буфер
ФЭУ – фотоэлектронный умножитель
ЦПМ – цитоплазматическая мембрана
ЭПР – эндоплазматический ретикулум
ЭФР – эпидермальный фактор роста
5-TAMRA – 5-carboxytetramethylrhodamine
CCD-матрица (ПЗС-матрица) – charge-coupled device (прибор с зарядовой связью)
DABCO – диазобициклооктан
DAPI – 4,6-диамидино-2-фенилиндол
DMD – digital micromirror device (цифровые микрозеркальные устройства)
EB – этидия бромид
FITC – флуоресцеинизотиоцианат
FLAP – Fluorescence Localization After Photobleaching (локализация флуоресценции после фотоотбеливания)
FLIM – fluorescence lifetime imaging microscopy (микроскопия для исследования времени жизни флуоресценции)
FLIP – Fluorescence Lossin Photobleaching (потеря флуоресценции во время фотоотбеливания)
FRAP – Fluorescence Recovery After Photobleachin (восстановление флуоресценции после фотоотбеливания)
FRET – Fдrster (Fluorescence) Resonance Energy Transfer (Фёрстеровская (флуоресцентная) резонансная передача энергии)
GPDH – глицерофосфатдегидрогеназа
LDH – лактатдегидрогеназа
PBFI – potassium-binding benzofuran isophtalate
PPI – пропидия йодид
PPDA – парафенилендиамин
RITC – родаминизотиоцианат
SBFI – sodium-binding benzofuran isophtalate
SDS – додецилсульфат натрия
SHIM – Second-harmonic imaging microscopy (микроскопия с использованием регистрации второй гармоники)
SNAP25 – Sy Naptosomal-Associated Protein, 25 kD
SNARE – Soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor Attachment protein Receptor
TRITC – тетраметилродамин-5(6) – изотиоцианат
ПРЕДИСЛОВИЕ
В последние годы благодаря достижениям квантовой физики, молекулярной биологии и иммуноцитохимии, классические морфологические дисциплины приобрели совершенный инструмент для молекулярного анализа клеточных и тканевых структур. Сейчас можно констатировать, что на основе всестороннего использования новых молекулярных подходов происходит выделение передового направления в морфологии – молекулярной морфологии. Молекулярная морфология, аккумулируя знания, накопленные классической гистологией, эмбриологией, и патологической анатомией, способна занять ключевое место в интеграции клеточной биологии, биохимии, физиологии, молекулярной генетики и протеомики при решении фундаментальных проблем и прикладных задач биомедицинских исследований. Молекулярная морфология, используя постоянно расширяющиеся возможности новых методов конфокальной микроскопии, а также оптической микроскопии сверхвысокого разрешения, в скором времени должна решить насущную задачу создания нового поколения методов трехмерного молекулярного анализа клеточных и тканевых структур, пригодных для использования не только в практике научного исследования, но и в диагностических целях. Ожидаемые новые методы должны быть просты, надежны в использовании, высокоселективны и высокочувствительны. Успешное решение поставленной задачи требует от исследователя глубоких знаний о современных методических приемах иммуноцитохимии, флуоресцентной и конфокальной лазерной микроскопии. Одной из важных задач, стоящих перед морфологом, занимающимся научными исследованиями, является участие в комплексных исследовательских программах, объединяющих специалистов разного профиля с целью решения конкретной научной проблемы. Квалифицированному специалисту-морфологу для успешного выполнения задач комплексных междисциплинарных исследований уже недостаточно владения только основами общей, частной морфологии и патологии, но требуется также и понимание главных биофизических принципов, лежащих в основе феноменов, используемых при создании приборов, предназначенных для флуоресцентной и конфокальной лазерной микроскопии. Без этого невозможно разобраться в сложных настройках современных приборов, от правильного использования которых зависит окончательный результат кропотливой подготовительной работы. Облегчить специалистам-морфологам и научным работникам смежных специальностей знакомство с новыми методами микроскопии и показать, как можно с их помощью решать различные задачи, связанные с изучением структур клеток и тканей, должна помочь настоящая книга.
Технической базой для реализации представленных в приложениях протоколов и иллюстраций, помещенных на вклейках, послужил комплекс оборудования и программного обеспечения, разработанный фирмой Zeiss (Германия), который включает конфокальные лазерные микроскопы LSM 710 и LSM 510 Meta. Иммуноцитохимические протоколы и общие принципы работы с конфокальным микроскопом универсальны и могут успешно использоваться с оборудованием любых производителей.
Настоящее руководство аккумулирует многолетний опыт сотрудников лаборатории функциональной морфологии центральной и периферической нервной системы отдела общей и частной морфологии Института экспериментальной медицины, связанный с использованием методов конфокальной лазерной микроскопии и иммуноцитохимии.
Научные исследования, результаты которых использованы при написании этой книги, были выполнены при поддержке Российского научного фонда (проект № 14-15-00014).
Д. Э. КоржевскийГлава 1.
ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ МИКРОСКОПИЯ И КОНФОКАЛЬНАЯ ЛАЗЕРНАЯ МИКРОСКОПИЯ – ПРИНЦИПЫ И ОСНОВНЫЕ МЕТОДЫ
Большинство биологических объектов обладают низким контрастом внутренних структур, которые в основном прозрачны, поэтому возможности их наблюдения методом классической микроскопии светлого поля ограничены. Эта проблема может быть преодолена несколькими путями: применением метода исследования в темном поле, использованием метода фазового контраста, для двулучепреломляющих материалов применяют поляризационный контраст. Основным же методом контрастирования в биологии является окрашивание препаратов веществами, способными связываться с препаратом и поглощать свет или флуоресцировать. Последние называют флуорохромами.
1.1. Основные понятия
Флуорохромы (флуоресцентные красители)1 – это вещества, которые способны связываться с объектом и расходовать часть энергии поглощенного света на флуоресценцию. Под флуоресценцией понимают способность ряда веществ после поглощения света с одной длиной волны излучать свет с другой длиной волны. Напомним, что электроны в атомах расположены на энергетических уровнях; расстояние между уровнями является характеристикой молекулы. При облучении вещества светом возможен переход электронов на более высокий энергетический уровень. Разница энергии между энергетическими уровнями и частота колебаний поглощенного света связаны между собой уравнением Бора (постулат Бора):
где ΔЕ – разность энергий между уровнями; v – частота; λ – длина волны; h – постоянная Планка; с – скорость света.
После поглощения света часть полученной системой энергии расходуется в виде тепла, а часть может быть излучена в виде фотона. Согласно правилу Стокса, длина волны испускаемого света больше, чем длина волны поглощаемого, или, другими словами, максимум спектра излучения сдвинут по отношению к максимуму спектра поглощения в сторону более длинных волн. С физическими основами описанных выше процессов более подробно можно ознакомиться в учебнике Р. Фейнмана (2011).
Каждый флуорохром характеризуется определенным спектром поглощения и испускания. Например, один из самых распространенных флуоресцентных красителей – FITC (fluorescein-5-isothiocyanate) – имеет максимум поглощения lex = 492 нм, а максимум излучения для него составляет lem = 518 нм. Другой распространенный флуорохром, 5-TAMRA (5-carboxytetramethylrhodamine), имеет lex = 543 нм и lem = 570 нм. На величину стоксова сдвига также влияет полярность среды, в которой находится флуорохром.
Наиболее интенсивной флуоресценции флуорохрома можно добиться, облучая его светом с длиной волны, близкой к максимуму поглощения, однако возможно перевести флуорофор в возбужденное состояние и при облучении его светом с длиной волны, существенно отличающейся от его максимума поглощения. Например, флуорофор можно перевести в возбужденное состояние двумя или тремя длинноволновыми фотонами (мультифотонное возбуждение), что будет эквивалентно возбуждению одним коротковолновым фотоном. Так, возбуждение двумя или тремя фотонами с длиной волны 900 нм эквивалентно возбуждению одним фотоном с длиной волны 450 или 300 нм.
- Морфологическая диагностика. Подготовка материала для гистологического исследования и электронной микроскопии - Коллектив авторов - Медицина
- Голографическая интерферометрия и лазерная микроскопия эритроцитов - Александр Николаевич Метелкин - Биология / Медицина / Сад и огород
- Отложение солей. Самые эффективные методы лечения - Юлия Попова - Медицина
- Справочник логопеда - Коллектив Авторов - Медицина
- Хроническая алкогольная интоксикация - Коллектив авторов - Медицина
- Домашняя медицинская энциклопедия. Симптомы и лечение самых распространенных заболеваний - Коллектив авторов - Медицина
- Болезни суставов - Коллектив авторов - Медицина
- Детские инфекционные болезни. Полный справочник - Коллектив Авторов - Медицина
- Миастения. Диагностика и лечение - Коллектив авторов - Медицина
- Табакокурение. Вред, способы отказа. Рекомендации всем кто курит и желает избавиться о табачной зависимости - Коллектив авторов - Медицина